Валентин Александрович Догель
1943-1946
Член-корреспондент АН СССР, доктор биологических наук, профессор. Первый директор.
Аркадий Андреевич Целищев
1946-1950
Доктор биологических наук, профессор
Илларион Григорьевич Галузо
1951-1967
Академик АН КазССР, доктор биологических наук, профессор
Аркадий Александрович Слудский
1967-1971
Член-корреспондент АН КазССР, доктор биологических наук, профессор
Евгений Васильевич Гвоздев
1971 – 1988
Академик АН КазССР, доктор биологических наук, профессор
Анатолий Михайлович Дубицкий
1989-1991
Доктор биологических наук, профессор
Турганбай Нурланович Досжанов
1991-1994
Член-корреспондент НАН РК (позже академик), доктор биологических наук, профессор
Аманкул Бекенович Бекенов
1995-2003
Доктор биологических наук, профессор
Алихан Мелдебекович Мелдебеков
2003-2008, 2008-2013, 2013-2017
Академик НАН РК, доктор сельскохозяйственных наук, профессор
Блок Шайкенович Шайкенов
2008
Доктор биологических наук
Роман Васильевич Ященко
2013, с 2018 г. по настоящее время
Доктор биологических наук